La revista The Analytical Scientist ha concedido uno de sus Premios de Innovación de 2018 a la herramienta bioinformática CEU Mass Mediator (CMM). Este premio es un reconocimiento a más de cinco años de trabajo conjunto entre el Centro de Excelencia en Metabolómica y Bioanálisis (CEMBIO) y el Laboratorio de Bioingeniería (Biolab) de la Universidad CEU San Pablo.
CMM es una herramienta de código abierto y disponible públicamente online que proporciona apoyo en las tareas de identificación e interpretación biológica de experimentos de Metabolómica. Actualmente la identificación de metabolitos es el principal cuello de botella en los experimentos metabolómicos, requiriendo una gran cantidad de trabajo manual y repetitivo por parte de los investigadores, y siendo muy propensa a fallos.
CMM integra información relativa a metabolitos presentes en múltiples bases de datos externas (HMDB, KEGG, LipidMaps, Metlin, y MINE), así como una base de datos generada por el CEMBIO, y emplea técnicas de inteligencia artificial para filtrar y ordenar de mayor a menor probabilidad las distintas anotaciones compatibles con los datos obtenidos del espectrómetro de masas. El corazón de la herramienta es un sistema experto basado en reglas construido a partir de conocimiento de químicos analíticos del CEMBIO que permite aplicar automáticamente la experiencia acumulada a lo largo de los años por los miembros de este equipo de investigación.
The Analytical Scientist, del grupo Texere, es una prestigiosa publicación científica que abarca una revista impresa, un sitio web global y una aplicación para iPad. Integra todos los aspectos de la química analítica. Los premios de Innovación 2018 fueron nominadas por los propios lectores y los ganadores fueron seleccionados por un panel de expertos independientes, junto con el equipo editorial de la publicación.
Pie de foto 1: De izquierda a derecha Joanna Godzien (investigadora principal a la hora de a definir cómo debe funcionar la herramienta), Coral Barbas (directora del CEMBIO y codirectora creación de esta herramienta -junto con el profesor de la Universidad CEU San Pablo Abraham Otero-) y Alberto Gil (principal desarrollador de la herramienta CMM).
Pie de foto 2: Resumen del flujo de procesamiento de datos típico en la herramienta.